一、先將水閥關閉。
二、開啟水源閥，使自來水從進水控制閥進入冷凝器，再從回水閥注入蒸發鍋，直至水位上升到玻璃水位表中心處，關閉水閥。
三、接通電源，當水沸后又蒸餾水滴出時重新開啟水源閥，并調節到冷卻水溢出有70℃左右，蒸餾水溫在40℃左右為好。
四、蒸餾水出口管用光潔的硅膠膠導管，導入潔凈的玻璃蒸餾水中。
五、每天使用前應洗刷內部一次，且將存水排盡，并更換新鮮水以保證水質。
六、蒸餾水器內水垢，可用弱酸或弱堿溶液洗刷，清除方便徹底。
七、新購進蒸餾水器，應先清洗，并經過2小時以上的通電蒸發，直到取得蒸餾水符合藥典要求。
